Кам'яний вік
Найдавніші сліди існування людини на території Молдови відносяться до раннього палеоліту (200-70 тис. Років тому). З цього часу відомі стоянки ашельской культури (гроти Старі Дуруїтори, Вихватінци). Стоянки мустьєрської культури (середній палеоліт - 70-40 тис. Років тому) знайдені у сіл Бутешти, Буздужани і Трінка. У пізньому палеоліті (40-10 тис. Років тому) з'явився сучасний тип людини - кроманьйонець (гроти: Бринзени I, Чутулешти I, Рашків VII).
Стоянки епохи мезоліту на території Молдавії (VIII-V тисячоліття до н. Е.) Знайдені у сіл Фрумушика і Саратени.
Найдавніша неолітична (V тисячоліття до н.е) культура на території Молдавії - буго-дністровська - відома по групі невеликих поселень, розташованих біля р Сороки. Наприкінці V тисячоліття до н. е. в межиріччі Дністра і Прута проникли племена культури лінійно-стрічкової кераміки.
На межі V-IV тисячоліть до н. е. в Дністровсько-Карпатських землях в результаті тісних контактів носіїв культур лінійно-стрічкової кераміки та буго-дністровської, сильного впливу Ніжнедунайской культури Боян зароджується трипільська культура мідно-кам'яного віку (енеоліту), що розвивалася близько 2 тис. років. Найбільш відомі пам'ятники: у м Флорешти, сіл Карбуна, Солончені, Бринзени, Вихватінци і Жура. У період мідно-кам'яного століття на півдні Молдавії жили також племена гумельницької культури, близькі трипільцям. Пам'ятники: у м Вулканешти і с. Лопатіца.
Бронзовий вік
У ранньому періоді бронзового століття (кінець III - перша третина II тисячоліття до н.е) серед племен, що населяли територію Молдавії, переважали кочові скотарі. У середньому (друга третина II тисячоліття до н.е) і пізньому (третя третина II тисячоліття - початок I тисячоліття до н.е) періодах населення стає осілим, займаючись як землеробством, так і скотарством.
В кінці періоду бронзи територія Молдавії була розділена на дві зони: лісостепову і степову. У лісостеповій зоні жили племена культури Ноа. У степовій зоні мешкали кіммерійці. Пам'ятники раннього і середнього періодів бронзи представлені головним чином курганними похованнями, розкиданими по всій країні.
Залізний вік
У першій половині I тисячоліття до н. е. в лісостепову частину Дністровсько-Прутського межиріччя просунулися фракійські племена - носії культури гальштата. У степовій частині продовжували жити кіммерійці.
У розвитку культури фракійського гальштату на території Молдавії виділяються три етапи: ранній (X-IX ст. До н. Е.- Кишинів, села Лукашівка, Миндрешти), що характеризується переходом від пізньої бронзи до раннього железу- середній (VIII-VI ст. До н. е.- р Шолданешти, с. Селіште), якому притаманне поширення залізних знарядь, і пізній (V ст. до н. е.) - перехідний від культури фракійського гальштату до гетського (села Данча, Пиржолтени).
IV-I століття до н. е. Гети
У період IV-III століть до н. е. на території Дністровсько-Прутського межиріччя були розселені гети (гето-даки) - одна з груп північно-фракійських племен.
Гети були об'єднані в союзи племен і знаходилися на стадії військової демократії. Розкопані селища і городище гетів (села Бутучени, Сахарна). Гети підтримували зв'язки з грецькими причорноморськими колоніями, про це свідчать монети з Тіри (сучасний Білгород-Дністровський) і глиняні грецькі амфори.
Наприкінці III - початку II століть до н. е. на територію гетів вторгаються поморские племена, які в письмових джерелах зазвичай ототожнюються з бастарнами або галатами. В результаті злиття утворилося населення, що створило нову матеріальну культуру - Лукашевський, в якій переважали гетського елементи.
У IV-III століттях до н. е. степову частину узбережжя Дністровського лиману заселяли осілі племена, в яких дослідники звичайно бачать нащадків елліно-скіфів Геродота. Під час військових походів і набігів в Дністровсько-карпатські землі проникали і кочові скіфи.
I-III століття н. е. Римський вплив
У I столітті до н. е. посилюється римська експансія в Нижньому Подунав'ї. Римляни створюють провінцію Нижня Мезія (сучасні Північна Болгарія і Добруджа). У 57 році н. е. вони вводять свій гарнізон в Тіру. На півдні Дністровсько-Прутського межиріччя стояли I Італійський і V Македонський легіони (черепиці зі штампелі цих легіонів були виявлені на лівому березі Дунаю, біля його гирла, біля села Орловка Одеської області). Деякі дослідники вважають, що так звані «Траянові вали», що перетинають межиріччі із заходу на схід, були споруджені римлянами - для боротьби з вторгавшимися кочівниками, проте дані, отримані в результаті розкопок, це не підтверджують.
Римська експансія прискорила формування у гето-даків ранніх політичних утворень. Так, в I столітті до н. е. відомо об'єднання гето-дакійських племен під керівництвом Буребісти, яке, однак, незабаром розпалося. Потім центр політичних утворень гето-даків пересунувся в район Карпат, де в I столітті до н. е. виникають ранні форми держави.
Після двох запеклих воєн (101-102 і 105-106) римський імператор Траян захопив частину земель гето-даків і утворив провінцію Дакія. Вона була заселена римськими і романізованими колоністами. Влада проводили політику романізації гето-даків.
Дністровсько-Прутське межиріччя (і, зокрема, територія сучасної Молдови) не ввійшло до складу провінції Дакія, і тут романізації як такої не було, проте населення цієї території також зазнавало певне римський вплив.
III-V століття. Варвари
У 271 році під тиском варварів римляни змушені були покинути Дакию і відступити на правий берег Дунаю. Частина романізованого населення була евакуйована, частина залишилася в містах і селах, в основному в передгірних областях. У ході «великого переселення народів» в Дакію проникали різні варварські племена: тайфали, герули, готи, вандали, гепіди, сармати та інші.
В умовах безперервних вторгнень мігруючих племен місцеве романізоване населення Дакії в основному було винищено. Лише мешканці передгір'їв - рухливі скотарі - під час набігів йшли у важкодоступні ліси і гори. У відносно спокійні періоди це романізоване населення поверталося в передгір'я. Згодом воно стало одним з елементів створюваного етносу волохів, предків східно-романських народів.
У III-IV ст. на території Молдавії була розвинена черняхівська культура (поселення біля сіл Будешти, СОБАР), носіями якої були фракійці, сармати, венеди, готи та ін.
В кінці IV століття гуни, що спустошили ці землі, розсіяли і знищили племена черняхівської культури, залишки якої пізніше були асимільовані слов'янами.
V-XI століття. Слов'яни
Наприкінці V - початку VI століть почалося широке проникнення слов'ян у Дністровсько-карпатські землі. Долини Дністра, Пруту та Сірету були зручними шляхами в просуванні слов'ян до Дунаю і на Балканський півострів. Осідаючи на землях між Дністром і Карпатами, слов'яни зустріли тут залишки колишнього населення і асимілювали його. Це підтверджує кераміка черняхівського типу, що зустрічається на території ранньослов'янських поселень.
Заселяли Дністровсько-карпатські землі слов'яни входили до складу двох великих племінних союзів - антського і склавинського. За свідченням готського історика Йордана, межа між ними в основному проходила по Дністру, проте на півдні межі антського союзу тягнулися аж до Нижнього Подунав'я. Письмові джерела згадують на північному узбережжі Нижнього Дунаю таких вождів як Ардагаст, Пірогаст, Мусоке. Одним з крайніх південно-західних антських племен були тиверці, які, як вказує недатована частина «Повісті временних літ», займали землі по берегах Дністра до Дунаю і Чорному морю. Залишки укріпленого поселення тиверців IX-XI століть виявлені у с. Екімауци (Екімауцкое городище).
Всього на території Молдавії відкрито більше 30 слов'янських поселень VI-VII століть (хуча, ганський (Ханський)) і близько 200 поселень VIII-IX століть (Бранешти, Лопатні, Одая, Алчедар).
У X столітті слов'янські племена, що мешкали в Дністровсько-Прутському межиріччі, знаходилися у сфері впливу, а часом і входили до складу Давньоруської держави. Південну частину Дністровсько-карпатських земель заселяли племена балкано-дунайського культури, носіями якої в основному були південні слов'яни, які проникли на територію Молдавії в період поширення впливу Болгарського царства на північ від Дунаю (IX-XI століття).
XI-XIII століття. Кочівники
З'явилися в X столітті в степах Північного Причорномор'я печеніги протягом століть постійно загрожували осілому населенню від Дніпра до Дунаю. У другій половині XI-XII ст. в Дунайсько-Дністровські землі перекочували половці (кумани).
В результаті вторгнення кочівників кількість слов'янських поселень Дністровсько-карпатських земель значно зменшилася. У північній лісостеповій області між Карпатами і Дністром в XII-XIII ст. проживали залишки слов'янського населення і проникали сюди з передгір'їв Карпат волохи. У XII-XIII ст. у північній частині Дністровсько-карпатських земель, а іноді і в усьому краї поширювалася влада Галицького князівства.
Уздовж Дністра, ближче до Галицьких земель, мешкали «вигонци» - слов'яни, які втекли від гніту бояр з володінь галицьких і волинських князів. В XI-XIII ст. в пониззі Дунаю існувало державне утворення Берладська земля, з центром у місті Берлад (сучасний Бирлад в Румунії), населення якого (берладники) також складалося з різноплемінних утікачів від феодального гніту з російських князівств.
По сусідству з галицькими «вигонцамі» розташовувалися бродники (земля бродників), відомості про яких надзвичайно мізерні. Частина половців осіла в районі річки Мілков- тут в XIII столітті існувала Куманська епископия, в межах якої проживали і волохи.
XIII-XIV століття. Золота Орда
Монголо-татари, розгромивши в 1237-40 російські князівства, рушили на захід, підкоряючи Дністровсько-карпатські землі, знищуючи крупні центри і поселення. Письмові джерела відзначають, що татари розорили куманских епископию і захопили землю бродників. Протягом другої половини XIII - першої половини XIV ст. частина монголо-татар влаштувалася на рівнинах поблизу гирла Дунаю, включивши південно-східну частину Дністровсько-карпатських земель до складу Золотої Орди. Решта території, в тому числі райони карпатських передгір'їв, безпосередньо не входила у володіння монголо-татар, але ймовірно знаходилася від них в певній залежності.
Влада Золотої Орди колонізували захоплену територію різноетнічним осілим населенням, внаслідок чого виникла синкретична золотоординська культура. У цей час з'явилися міста, відомі по розкопках у сіл Костешти (Яловенський район) та Требужени (Старий Орхей), в закруті річки Реут, в 18 км на південний схід від сучасного Оргеєва. На південному сході краю продовжували існувати два старовинні торгових міста - Білгород (Монкастро) і Кілія (Лікостомо), в яких переважав генуезький торговий капітал.
Протягом XII-XIV століть, в результаті переселення в Дністровсько-карпатські землі, волохи поступово стають тут основним населенням. Найбільш ранні відомості про волохів на півночі від Дунаю містяться в давньоруському літописі «Повість временних літ», в якій вказується, що в 898 році волохи разом із слов'янами жили десь в Карпатах і на захід від них. Перша згадка про волохів, які проживали поблизу кордонів Галицької Русі, зустрічається в творі візантійського історика М. Хониата (1164). Найбільш густо заселеними в XIV столітті були райони Східного Прикарпаття. Вони стали центром формування Молдавської держави. (Заселення волохами Лівобережжя Дністра проходило пізніше - в XVI-XVIII століттях.)
XIV-XVI століття. Молдавське князівство
У XIV столітті Золота Орда занепала. Землі на захід від Прута, розташовані на околиці володінь Орди, раніше інших позбавилися від монголо-татарського ярма. У середині 1340-х років угорці розгромили золотоординське військо. Землі в басейні річки Молдова (західна частина майбутнього Молдавської держави) опинилися під владою угорських королів.
У 1359 році, в результаті повстання проти угорського панування, на цій території виникло самостійне Молдавське князівство на чолі з Богданом I, колишнім до того волоським воєводою в Марамуреше і васалом угорського короля. Незабаром після цього у татар було відвойовано межиріччі Прута і Дністра. До 1400 до складу князівства була включена фортеця Білгород (сучасний Білгород-Дністровський). Східною межею князівства була річка Дністер. Західний кордон проходила по вершинах Карпатських гір, південна - по Чорному морю, річкам Дунай, Сірет та Мілков. На півночі природного кордону не було, Покуття тривалий час було спірною областю через яку між Молдавією і Польщею велися війни. (Сучасна Республіка Молдова займає середню частину східного регіону історичної Молдавії.)
У 1359 на території між Східними Карпатами і Дністром утворюється Молдавське князівство. Його столицею стають спочатку Байя, потім Сучава, а потім Ясси. У 1456 воно потрапляє у васальну залежність від Туреччини. У 1774 за Кючук-Кайнарджийським світу Молдавія потрапляє під протекторат Росії. За умовами Бухарестського світу, укладеного в 1812, частина цієї території - між Прутом і Дністром - відійшла до Росії, де її називали Бессарабія.
1853-1856 - див. Кримська війна. 24 січня 1859 князівства Молдавія і Валахія (Мунтенія) об'єднуються в Румунію. У січні 1918 була проголошена незалежність Демократичної Республіки Молдова, а 27 березня 1918 було прийнято рішення про возз'єднання з Румунією. У 1940 в результаті підписання Пакту Молотова-Ріббентропа Бессарабія була приєднана до СРСР і проголошена Молдавської РСР, до складу якої увійшли 9 бессарабських повітів і 6 районів Лівобережжя Дністра, що входили до цього до складу Української РСР. (До складу нинішньої Республіки Молдова не увійшли землі Південної Бессарабії і Північної Буковини, що увійшли до складу України).
23 червня 1990 Молдова заявляє про свій суверенітет, а 27 серпня 1991 - про державну незалежність. Першим президентом незалежної Молдавії став Мірча Снєгур. У 1990 на тлі тенденцій щодо інтеграції Молдавії до Румунії в південно-східних регіонах республіки серед місцевого слов'янського населення посилилися сепаратистські настрої, які призвели до створення Придністровської Молдавської Республіки зі столицею в Тирасполі (див. Придністровська Молдавська Республіка).
Це спровокувало Придністровський конфлікт 1990-1992, який досяг своєї кульмінації в березні 1992, коли Кишинів спробував відновити контроль над містом Дубоссари, і в червні 1992, коли розгорнулися запеклі бої за місто Бендери між урядовими військами Молдавії і гвардійцями Придністров'я, яких підтримували добровольці з інших країн, головним чином з Росії. Конфлікт був заморожений завдяки втручанню частин російської 14-ї армії влітку 1992 року.
29 липня 1994 була введена в дію нова конституція. Цей документ відобразив «молдавську» орієнтацію нової політичної більшості. Посилання на румунську мову і румунський народ, які характеризували головні положення ранніх проектів конституції, були вилучені і замінені посиланнями на молдавську мову і молдавський народ, в той час як національна незалежність зберігалася в якості головного принципу молдавської державності.
Розчарування в цих доповненнях до конституції викликало протест з боку студентських груп в березні-квітні 1995. Щоб приборкати прояви невдоволення, президент Снігур ввів шестимісячний мораторій на обговорення питання про мову і створив спеціальну комісію для його розгляду. У той же час парламент двічі - в 1994 і 1995 - відкидав пропозицію визнати румунський як державної мови.
У червні 1995 президент Снігур відійшов від керівництва АДП, не погодившись з її вимогою затвердити румунський мову як державну. Конфлікти Снєгура з керівництвом АДП не припинялися. Коли він в 1996 спробував відправити у відставку міністра оборони Павла Крянге, парламент визнав це рішення неконституційним.
На президентських виборах у листопаді 1996 жоден з кандидатів не набрав необхідних 50% голосів. Повторні вибори відбулися в грудні, в першому турі Снігур отримав 39% голосів, а кандидат від АДП Петро Лучинський - 28%. Лучинський виграв другий тур з 54% голосів і в січні 1997 вступив на посаду президента.
У перший рік президентства Лучинський наполегливо підтримував економічні реформи. Основним опонентом ринкових реформ виступала ПКМ. На парламентських виборах у березні 1998 комуністи завоювали 30% голосів (40 місць) в парламенті. Оскільки жодна з партій не отримала вирішальної більшості місць, було сформовано коаліційний уряд за участю Руху за демократичну і процвітаючу Молдавію, Демократичної конвенції Молдови та Партії демократичних сил. Новий парламент визнав румунський державною мовою Молдавії.
Конституція 1994 підтвердила незмінний нейтралітет Республіки Молдови в міжнародних відносинах. Статус Придністров'я спеціально не робив застереження, але констатувалося, що населеним пунктам лівобережжя Дністра можуть бути надані особливі форми та умови автономії. Детальні переговори з приводу статусу Придністров'я велися в 1995. У 1996 уряду Молдови і Придністров'я прийшли до угоди про автономний статус Придністров'я.
Хід переговорів стримувався через непрекращавшихся суперечок про умови виведення російських військ і військової техніки з Придністров'я. Східна частина колишньої Молдавської РСР, невизнана Придністровська Молдавська Республіка (ПМР) зі столицею в Тирасполі де-факто не входить до складу Республіки Молдова. Законодавча і виконавча гілки влади ПМР ігнорують закони Молдови. ПМР має всі атрибути державності (прапор, столицю, президента, парламент, митниці, міліцію, фінанси).
На противагу ПМР лідери Гагаузії в кінці 1994 досягли угоди з урядом Молдавії про умови автономії. Відповідно до них районам Гагаузії гарантувалося місцеве самоврядування, і гагаузька мова стала одним з трьох офіційних мов - поряд з молдавським і російським. Народні збори Гагаузії (Халк Топлошу) отримало обмежені законодавчі повноваження.
Вищою посадовою особою Гагаузії є її глава (башкан), який обирається строком на чотири роки на основі загального, рівного, прямого виборчого права при таємному і вільному голосуванні на альтернативній основі. На регіональному референдумі, що відбувся в березні 1995, були визначені офіційні межі Гагаузії.
До кінця 1998 Молдавія зіткнулася з найсильнішим за роки незалежності кризою. В економіці він був обумовлений різким падінням торгового обороту з Росією після дефолту 17 серпня 1998, подальшим зниженням промислового виробництва і скороченням ВВП (в 1998 у порівнянні з 1997 відповідно на 10% і 7%), девальвацією лея на 50%, зростанням цін на продукти на 20-40%. Ухвалений 12 грудня 1998 бюджет (дохідна частина - 2,25 млрд. Лей, або 300 млн. Дол., Видаткова - 2,45 млрд. Лей, або 330 млн. Дол.) Приймався з розрахунком на кредити МВФ, які в 1999 поступали із затримками. У січні 1999 ціни на комунальні послуги і деякі товари піднялися на 70%.
Вихід з кризи керівництво Молдавії вбачає в посиленні фінансової дисципліни та переорієнтації торговельних зв'язків на країни СНД, Близького Сходу та Китаю. У внутрішній політиці президент Лучинський на консультативному референдумі 23 травня 1999 в ході виборів до місцевих органів влади поставив питання про введення президентського правління, змінивши тим самим деякі положення Конституції 1994. Це пропозиція не отримала підтримки більшості.
На дострокових виборах до парламенту 25 лютого 2001 перемогу здобула партія комуністів. 4 квітня 2001 їхній лідер Володимир Воронін був обраний президентом.